Фамилия Петунников образована от прозвища Петунник, которое восходит к слову «петун»: во многих говорах так называют петуха. Суффикс –ник указывает на то, что прозвище могло говорить и о роде деятельности предка. Петунником могли прозвать того, кто разводил кур и петухов или ухаживал за ними на барском дворе. Однако не исключено, что такое прозвище получил задиристый или гордый человек, то есть напоминавший своим поведением петуха. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Петунник, со временем получил фамилию Петунников.