Фамилия Пилищукова — женская форма фамилии Пилищуков, и её происхождение стоит искать в мужском варианте. В основе лежит прозвище или мирское имя Пилищук, а оно, в свою очередь, образовано от глагола «пилить» или существительного «пила». Казалось бы, всё очевидно: предок мог быть пильщиком, лесорубом или плотником. Однако суффикс -ук/-юк указывает на западнорусское или украинское происхождение: в этих землях так называли не столько по профессии, сколько по характерному действию или внешности. «Пилищук» — это скорее «тот, кто пилит», но не обязательно профессионально: могли дать прозвище за манеру говорить резко, «пилить» кого-то упрёками, или за длинный, острый нос, напоминающий пилу.

Версия с профессией тоже не отпадает, но в украинской и белорусской традиции названия ремесленников чаще оформлялись суффиксом -арь (Пильщик, Пилляр). А вот -ук — типичный уменьшительно-притяжательный суффикс, означающий «сын» или «ученик»: Пилищук — «сын Пилилы» или «маленький пильщик». То есть фамилия могла закрепиться за младшим членом семьи, который перенял отцовское дело или получил прозвище по сходству с отцом-пильщиком.

Интересная деталь: в русских говорах слово «пиликать» означало «играть скучно, однообразно», а «пилила» — капризный, нудный человек. Если предок был из северных или центральных областей, где фамилии на -ук редки, то Пилищуков мог быть выходцем с Украины или Беларуси, переселившимся. В таком случае фамилия сохранила региональный отпечаток, а окончание -ов добавилось уже на русской почве по модели «чей?» — Пилищуков, то есть «принадлежащий роду Пилищуков».

Встречаемость фамилии невысокая, что говорит о её локальном происхождении. Скорее всего, родоначальник жил в одном из сёл на границе современных Украины, Беларуси и России, где такие прозвища были в ходу. Написание с буквой «щ» — характерный признак восточнославянской фонетики: в украинском языке «пилищук» звучало бы как «пилищук», а в русском адаптировалось через «щ». Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Пилищу́кова.