Фамилия Пилюковы относится к древнему пласту русских фамилий, образованных от личного имени. В её основе лежит имя или прозвище Пилюк, и здесь у исследователей есть две основные версии, которые стоит разобрать по отдельности.

Первая гипотеза связывает имя Пилюк с православными крестильными именами Филимон или Филипп. В древнерусском языке не было буквы «ф», и при заимствовании греческих имён её заменяли на «п» или «х». Так Филимон (от древнегреческого «любить») и Филипп («любитель лошадей») в народной среде превращались в Пилимона и Пилиппа. Уменьшительная форма Пилюк от этих имён звучит естественно: подобные сокращения с суффиксом -юк широко бытовали в разговорной речи. Эта версия выглядит правдоподобной, поскольку модель «крестильное имя → народная форма → фамилия» дала огромное количество русских родовых имён.

Вторая гипотеза предлагает прозвищное происхождение. Она опирается на украинское нарицательное «пильга» — «льгота», «освобождение от общих правил». Если следовать этой логике, Пилюком могли прозвать «обеленного» крестьянина, то есть освобождённого от податей и повинностей. Однако здесь есть слабое место: связь между «пильгой» и формой «Пилюк» требует дополнительных фонетических допущений, а потому уступает первой версии в убедительности.

Суффикс -ов в окончании фамилии указывает на притяжательное значение: Пилюков буквально означает «сын Пилюка», «из рода Пилюка». Такая модель закрепилась в русской ономастике к XVII веку, когда фамилии стали передаваться по наследству и фиксироваться в документах.

Интересно, что фамилия не получила широкого распространения и осталась относительно редкой, что типично для родовых имён, произошедших от уменьшительных форм, а не от полных календарных имён. В этом её ценность: она сохранила живую народную традицию именования, которая уходила корнями в повседневный быт, а не в официальную церковную запись.

Таким образом, фамилия Пилюковы — это памятник славянской письменности и культуры, который через простое личное имя связывает современного носителя с далёкими предками, носившими имена Филимон или Филипп в их народном, адаптированном звучании.