Фамилия Пиньчукова бросается в глаза необычным корнем. Если отбросить суффикс -ов-, указывающий на принадлежность (буквально «чей?» — человек из рода Пиньчука), то основа — Пиньчук. Сама по себе эта основа состоит из корня Пинь- и суффикса -чук, который на юго-западе России, в Белоруссии и на Украине был одним из главных способов образовать фамилию от прозвища или имени. Суффикс -чук в тех краях играл ту же роль, что и -ов в центральной России: он означал «сын такого-то» или «маленький, молодой».

Корень Пинь- — самый спорный и интересный элемент. В русских говорах слово «пинь» или «пиня» могло означать человека медлительного, вялого, «тюрю». Однако гораздо чаще в основе прозвищ лежало диалектное слово «пинькать» — издавать тонкий, писклявый звук. Прозвище Пинька, а затем и Пиньчук, скорее всего, дали человеку с высоким голосом, тому, кто постоянно ныл или канючил. Прямых параллелей с тюркскими или финно-угорскими корнями нет, поэтому версия с русским диалектным звукоподражанием выглядит самой правдоподобной.

По модели образования фамилия Пиньчукова — типичный пример того, как южнорусская или белорусская фамилия на -чук получила «великорусское» окончание -ов при адаптации в официальных документах. В исходной форме, без суффикса -ов, фамилия звучала бы как Пиньчук, и именно так её могли записать в метрических книгах на территории современной Украины или Брянской области. Перенос ударения на последний слог (Пиньчуко́ва) — признак того, что фамилия прошла через церковнославянскую или канцелярскую традицию, где ударение часто ставили по модели отчества.

Сословная принадлежность носителей фамилии, скорее всего, была крестьянской или мещанской. Фамилии на -чук редко встречались у дворянства, которое предпочитало модели на -ский или -ов с более «статусным» звучанием. Встретить Пиньчуковых можно в западных областях России, в Белоруссии и на востоке Украины, причем написание могло колебаться: Пинчуков, Пиньчуков, а иногда и Пинчук — без наращения. Разница в одну букву «ь» часто зависела от того, как местный писарь слышал мягкое произношение корня.