Фамилия Плахотины ведет начало от личного прозвища Плахота — так в старину могли назвать человека, чье занятие или внешний вид были связаны с тканью и одеждой. Основа фамилии восходит к диалектному слову «плахата», у которого в разных губерниях были свои значения. В курских говорах так называли юбку или поневу, в тверских — золототканый платок, а в новороссийских — шерстяной платок, который женщины оборачивали вокруг пояса. Поэтому прозвище Плахота могли дать либо швецу, либо торговцу женской одеждой.

Суффикс -ин в фамилии Плахотин указывает на притяжательную модель образования: так закреплялось имя главы семьи, и потомки Плахоты со временем стали Плахотиными. Эта словообразовательная схема типична для русских фамилий, но сама основа встречается редко, что делает фамилию заметной на фоне более частых прозвищных фамилий от имен или ремесел.

Точное место и время возникновения фамилии Плахотин установить сложно — фамилии на Руси складывались постепенно, на протяжении нескольких столетий, и письменные источники фиксируют их с большим опозданием. Однако диалектная география слова «плахата» подсказывает, что корни фамилии стоит искать в центральных и южных регионах России, где эти говоры были распространены.

В отличие от более прозрачных фамилий, образованных от крестильных имен, Плахотин хранит память о бытовой культуре: о том, как одевались женщины в разных местностях и какие ремесла кормили их семьи. Фамилия не получила широкого распространения, но именно это делает ее ценным памятником славянской письменности и живого народного языка.