Фамилия Плахотько звучит как типичная украинская или белорусская фамилия, и это первое, что бросается в глаза. Суффикс -ко (с ударением на последний слог или на основу) в восточнославянской ономастике — один из самых продуктивных. В украинском языке он часто выполнял уменьшительную или «сыновью» функцию: Плахотько могло означать «маленький Плахот» или «сын Плахотя». Но основа здесь не имя, а прозвище.

Корень фамилии — «плах-». В украинском и белорусском языках слово «плахта» означает кусок грубого холста, половик, а также женскую юбку из домотканой материи. В переносном смысле «плахотка» или «плахоть» — нечто рваное, неопрятное, либо, наоборот, прочное и грубое. Прозвище Плахоть мог получить человек, который ходил в плохой одежде, занимался ткачеством или торговлей холстами. В польском языке есть слово «płachta» (простыня, парус), что указывает на возможное влияние западных диалектов.

Менее вероятная, но встречающаяся в некоторых говорах версия связывает «плахоть» с диалектным глаголом «плахать» — махать, размахивать, или с существительным «плаха» (колода, чурбан). В таком случае прозвище могло относиться к неуклюжему, тяжелому на подъем человеку. Однако связь с тканью и одеждой кажется более естественной для бытового прозвища.

Географически фамилия Плахотько почти наверняка происходит из западных регионов Украины или юго-востока Беларуси, где суффикс -ко особенно распространен. Встречаются также варианты Плахотко, Плахота, Плахотнюк. Если предок носил фамилию Плахотько, он, скорее всего, был крестьянином или ремесленником, а прозвище дали по внешнему виду или роду занятий — например, за то, что ходил в холщовой одежде или торговал сукном.