Фамилия Подерегин — редкий случай, когда прозвище не просто перешло в фамилию, а сохранило в основе почти дословный отпечаток действия. Её ядро — глагол «подереть», который в старых русских говорах означал «разодрать», «распороть», «содрать кожу» или «износить до дыр». В прямом смысле так могли прозвать драчуна, задиру, человека, который в ссоре «подрал» противника. Но есть и бытовая версия: Подерегой называли сапожника или портного, который «дерёт» старую кожу или ткань, либо просто неаккуратного работника, портящего материал. В любом случае прозвище звучало как Подерега — от основы «подёр-» с суффиксом -ег-, который в русской антропонимии встречается нечасто (сравните с фамилиями Рычагов, Болдырев, Телегин). Этот суффикс придавал слову оттенок лица, склонного к действию.

Фамилия образована по стандартной патронимической модели: Подерега → Подерегин, то есть «сын Подереги». Ударение, скорее всего, падает на третий слог: Подере́гин. Географически фамилия тяготеет к центральным и южным областям России — Воронежской, Тамбовской, Ростовской, где глагол «подрать» в значении «изодрать» был в ходу вплоть до XX века. Встречается она редко: по данным современных баз, носителей Подерегиных по всей России не более нескольких сотен, что делает фамилию локальной и не подвергшейся массовому переоформлению через -ов/-ев.

Словообразовательно интересно, что в фамилии сохранился древний суффикс -ег-, который в русском языке почти исчез из нарицательной лексики, но задержался в прозвищах. Если бы прозвище звучало как «Подорванный» или «Подранный», оно бы дало фамилию Подорванов или Подранков, но Подерегин — более архаичный вариант, где действие схвачено в самом процессе, а не в результате. Это редкий пример того, как фамилия консервирует не только слово, но и грамматическую форму древнего глагольного имени.