Фамилия Подёрин — яркий пример того, как прозвище, данное человеку за манеру поведения, закрепилось в родовом имени. Её основа — древнерусское слово «подёра». В говорах так называли драчуна, забияку, сварливого человека, который постоянно лезет в ссоры и «дерёт» других. Корень здесь общий со словами «драть», «драка», «продираться». Суффикс -ин указывает на принадлежность: Подёрин буквально означает «сын Подёры» или «из рода Подёры».

Версия о происхождении от географического названия (например, речки или деревни Подёра) менее вероятна, но не исключена. Такие топонимы встречаются на Русском Севере, где «подёр» могли называть расчищенный под пашню участок леса — «подранное», выдранное место. Однако для фамилии Подёрин прозвищная версия выглядит убедительнее: по модели образования она стоит в одном ряду с фамилиями Драчёв, Дериглазов, Задирин.

Слово «подёра» фиксируется в диалектных словарях, в частности, в архангельских и вологодских говорах. Это сразу указывает на географию фамилии: скорее всего, её корни — в северных и северо-восточных землях Древней Руси. Встречаются и варианты написания с «е» — Подёрин, и с «ё» — Подёрин (ударение падает на второй слог). Вариант с «е» мог закрепиться в документах из-за особенностей дореволюционной орфографии, где «ё» часто не писали.

Фамилия Подёрин — редкая, не входит в сотни самых распространённых. Носители её, как правило, сосредоточены в Вологодской, Архангельской и Кировской областях, что подтверждает северное происхождение. Социальный состав предков мог быть разным: от крестьян до посадских людей, но именно в крестьянской среде прозвища, описывающие характер, давались особенно часто и метко.