Фамилия Подобиенко — характерный пример украинской фамилии, образованной по продуктивной модели с суффиксом -енко. Этот суффикс в Украине XVI–XVIII веков означал «сын» или «потомок», то есть Подобиенко — буквально «сын Подобия». Основа здесь — прозвище или некалендарное имя Подобий.

Корень «подоб-» в восточнославянских языках многозначен. Самое прямое значение — «похожий, сходный». Прозвище Подобий могли дать человеку, который напоминал кого-то из родни (например, «весь в отца»), или же тому, кто копировал чужие манеры, подражал. В народной речи слово «подобий» иногда закреплялось за человеком с яркой внешностью — «божий подобий», то есть красивый, статный. Не исключено, что прозвище имело ироничный оттенок: так могли назвать того, кто неудачно или смешно подражал другим.

Менее очевидная, но возможная версия связывает фамилию с церковнославянским словом «подобие» в значении «икона, образ». Тогда Подобиенко — потомок человека, который писал иконы или был причетником при храме. Однако эта гипотеза слабее: прозвищ от ремёсел обычно образовывались прямее (Иконник, Образцов), а «подобие» в бытовой речи для обозначения иконописца не закрепилось.

Географически фамилия тяготеет к центральным и восточным областям Украины — Полтавщине, Черкащине, Киевщине. В России она встречается редко, в основном среди потомков переселенцев с Украины. Вариантов написания немного: Подобенко (с одним «и») встречается, но реже; утрата гласного в суффиксе (Подобенко вместо Подобиенко) могла возникнуть при записи фамилии в русских документах.

Социальный контекст прост: фамилии на -енко в массе своей принадлежали казакам и крестьянам, реже — мещанам. Дворянских родов с таким окончанием почти нет, так как польская и российская знать предпочитала фамилии на -ский. Поэтому Подобиенко — фамилия, скорее всего, свободного или зависимого земледельца, запорожца или ремесленника, чей предок получил прозвище за внешнее сходство с кем-то или за манеру поведения.