Фамилия Подпольный звучит интригующе, но её происхождение прозаичнее, чем можно подумать. В основе лежит не подпольная деятельность, а слово «подпол» — пространство под полом, погреб. В крестьянском быту подпол служил хранилищем для запасов, и прозвище Подпольный могли дать тому, кто жил в таком помещении, либо, что вероятнее, человеку, который часто туда спускался — например, ключнику или приказчику, ведавшему припасами.

Фамилия образована по типичной для русской ономастики модели: основа «подпольн-» плюс суффикс притяжательного прилагательного «-ый». В отличие от фамилий на «-ов» и «-ин», которые указывают на принадлежность отцу («чей сын?»), фамилии на «-ский» и «-ый» чаще имеют территориальное или описательное значение. «Подпольный» — это прозвищная фамилия, которая прямо характеризовала человека по месту его обитания или занятию. В говорах встречалось и слово «подпольщик» в значении «живущий в подполе», но фамилия закрепилась именно в краткой форме прилагательного.

Интересно, что фамилия Подпольный — редкая, нечастотная. Она почти не встречается в центральных областях России, где преобладают массовые фамилии на «-ов». Очаги её бытования — южные регионы, в частности, Украина и юг России, где суффикс «-ый» в фамилиях более распространён. Там же могло возникнуть и прозвище, связанное с особенностями жилья: в малороссийской хате подпол был обязательным элементом, и человек, постоянно копавшийся в погребе, получал соответствующее прозвище.

Есть и другая, менее вероятная версия: фамилия могла образоваться от имени или прозвища Подпол, а уже от него — Подпольный. Однако прямых свидетельств существования такого имени в древнерусских антропонимиконах нет. Словарь Б. Унбегауна относит подобные фамилии к разряду «искусственных» или семинарских, но для Подпольного это маловероятно: духовные фамилии чаще образовывались от названий церквей или праздников, а не от бытовых реалий.

Таким образом, предок носителя фамилии Подпольный — скорее всего, крестьянин или ремесленник, живший в южнорусских или украинских землях, которого окружающие запомнили по его частому пребыванию в подполе. Никакой тайны, кроме бытовой.