Фамилия Подсекайлов звучит нарочито по-русски, но её основа неочевидна. В ней отчётливо выделяется глагольный корень сек-/сеч- и приставка под-, а суффикс -айл- встречается в русских фамилиях нечасто. Скорее всего, перед нами прозвище, образованное от глагола подсекать — рубить, подрубать, делать подсечку.

Самая прямая версия: прозвище Подсекайло могли дать лесорубу или плотнику, который занимался подрубкой деревьев, «подсекал» их, готовя к валке. В северных и сибирских говорах подсекать означало также делать засечку, затес на дереве — так метили границы участков или указывали направление. Человек, который ставил такие метки, тоже мог получить прозвище Подсекайло.

Суффикс -айло в русских прозвищах и фамилиях (сравните: Ломайло, Ковыряйло, Пугайло) часто указывает на деятеля, причём с оттенком многократности или привычности действия. То есть Подсекайло — не тот, кто однажды подсек, а кто постоянно этим занимается, мастер подсечки. Такие прозвища были особенно распространены в южнорусских и украинских землях, где суффикс -айло встречается чаще, чем на севере.

Есть и более специальная версия, связанная с пчеловодством. В некоторых диалектах «подсекать» значило вырезать соты из улья, забирать мёд. Прозвище Подсекайло мог получить пасечник. Эта версия менее вероятна, но возможна, если фамилия бытует в регионах традиционного бортничества или пасечного хозяйства.

Фамилия Подсекайлов — патронимическая, то есть образована от прозвища отца: Подсекайло → Подсекайлов («сын Подсекайла»). Форма с суффиксом -ов указывает на «притяжательность»: чей? — Подсекайлов. Это стандартная модель для русских фамилий, возникших из прозвищ на -о.

Географически фамилия редкая, её следы ведут в основном в южные и центральные области России, а также на Украину. Встречается она и в казачьей среде, где прозвища были особенно образными и часто фиксировали ремесло или характерную черту. Споров вокруг этимологии почти нет: большинство исследователей сходится на «подсечке» как основном значении.