Фамилия Подточина — яркий пример того, как географический объект или гидрологическая особенность местности может стать основой для прозвища, а затем и фамилии. Её основа — слово «подток» или «подточина». В русских говорах «подточина» — это место, где вода подмывает берег, образуя углубление, омут или промоину. Человек, живший у такого обрывистого берега, на речной излучине, где берег постоянно подтачивается течением, легко получал прозвище Подточина. Фамилия образована по самой распространённой модели: от прозвища на -а с помощью притяжательного суффикса -ин, который указывал на принадлежность роду: «чей сын?» — Подточина.

География фамилии довольно показательна. Больше всего носителей фамилии Подточина встречается в регионах с развитой речной сетью: в Сибири (особенно в Красноярском крае и Иркутской области), на Урале, а также в центральных областях России. Это косвенно подтверждает её «водную» природу — фамилия закрепилась в местах, где люди селились вдоль рек, и рельеф берегов играл важную роль в хозяйстве и быту. Встречается и мужской вариант — Подточин, но женская форма на -а в документах нередко фиксировалась как основная, что говорит о её давнем бытовании в качестве фамилии, а не отчества.

Интересно, что в некоторых диалектах «подточина» могла означать не только промоину, но и подземный ключ, родник, бьющий из-под земли. Это добавляет фамилии ещё один смысловой оттенок: предок мог жить не у реки, а у родника. Также не стоит путать фамилию с однокоренными Подтесов, Подтоптанный или Подтопельник — у них совершенно разная мотивация. В отличие от них, Подточина прямо указывает на природный объект, а не на действие или предмет.

В дореволюционных переписях эта фамилия не была дворянской или купеческой. Она типична для крестьянского и мещанского сословия, что подтверждает её прозвищное происхождение. Фамилия не получила широкого распространения в столицах, оставаясь локальной, «речной» — и в этом её своеобразие.