Фамилия Поганенкова образована от мужского имени или прозвища Поганя. Перед нами классическая отчества, построенная по модели «имя отца + суффикс -енков». Суффикс -енков указывает на происхождение от имени, оканчивающегося на мягкий согласный или -а/-я, и типичен для фамилий, сложившихся в северных и центральных русских говорах. Потомок человека по имени Поганя со временем стал Поганенковым, а его дети и внуки, в зависимости от пола, носили фамилию Поганенковы или Поганенкова.

Самая распространённая версия связывает основу с мирским именем Поганя. В древнерусской традиции такие имена давали не в обиду, а как оберег. Считалось, что злые духи не позарятся на ребёнка с «плохим» именем, и он вырастет здоровым. Прилагательное «поганый» в старом языке означало «дурной, пакостный, гадкий», но родители, надеясь видеть сына красивым и добрым, нарекали его Поганей именно с этой охранительной целью.

Существует и вторая гипотеза, более прозаическая. Она выводит прозвище Поганя из диалектного слова «погон», у которого несколько значений. В разных местностях так называли пространство для выпаса скота, слабую водку, плот для сплава и даже поздние всходы хлеба. Если следовать этой логике, прозвище Поганя относится к «профессиональным» именованиям и указывает на род занятий основателя фамилии: он мог быть пастухом, винокуром, плотовщиком или земледельцем. Эта версия правдоподобна, но уступает первой по распространённости: охранительные имена встречались чаще, чем прозвища от редких диалектных слов.

Какая из версий верна для конкретной семьи, сегодня сказать трудно. Но обе они рисуют портрет предка — человека, жившего несколько веков назад, чьё имя или занятие дало начало фамилии, которая дошла до наших дней.