Фамилия Понькин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Понька — это просторечная краткая форма крестильных мужских имен Понтий и Ферапонт. Первое из них в переводе с греческого означает «морской», а второе — «слуга». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Понька, со временем получил фамилию Понькин. О точном месте и времени возникновения фамилии Понькин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Понькин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.