Фамилия Попырин ведет начало от прозвища Попыра, которое восходит к глаголу «попырять», то есть «потолкать». Слово это звучит живо и даже несколько грубовато, и за ним угадывается характер человека: скорее всего, основатель рода был вспыльчивым, горячим и не прочь был пустить в ход кулаки. Впрочем, есть и другая, более тонкая версия: Попырой могли наречь ребенка намеренно, как охранительное имя. В языческой традиции считалось, что если назвать дитя «задирой» и «забиякой», то оно вырастет противоположностью этого прозвища — послушным и спокойным. Так прозвище, данное по характеру или с обережной целью, закреплялось за человеком и переходило к его потомкам уже в виде фамилии.

Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: Попырин означает «сын Попыры», «ребенок того, кого звали Попыра». Такая модель типична для северорусских и восточнославянских фамилий, где притяжательная форма образовывалась напрямую от прозвища отца. Сам корень «пыр-» родственен словам «упырь», «порыв» и другим древним основам со значением толчка, тычка, резкого движения. В диалектах «попырять» могло означать не только «толкать», но и «бодать», «колоть», что добавляет прозвищу оттенок упрямства и неуступчивости.

Безусловно, фамилия Попырин — самобытный памятник славянской культуры, но процесс формирования каждой отдельной фамилии мог быть длительным и не всегда имел привязку только к одной местности. Окончательно говорить о точном времени и месте происхождения фамилии Попырин можно лишь на основании серьёзных генеалогических исследований, которые учитывали бы переписи, писцовые книги и устную традицию конкретных родов.