Фамилия Потокер — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычного русского суффикса -ов или -ин, зато есть характерный суффикс -ер, который указывает на иноязычную, скорее всего, ашкеназскую (еврейскую) основу. В восточноевропейской еврейской ономастике суффикс -ер часто обозначал профессию или род занятий: например, беккер (пекарь), шустер (сапожник), малер (художник). Потокер, скорее всего, из того же ряда.

Что могло лежать в основе? Наиболее вероятная версия — от идишского «поток» или немецкого «Potock» в значении «ручей», «поток». Тогда Потокер — это человек, живший у ручья, у водного потока, либо выходец из места с таким названием (например, из местечка Поток, Потоки). Такая топонимическая модель широко распространена: фамилия указывала на географическую привязку предка. Менее правдоподобно, но не исключено, что корень восходит к польскому «potok» — то же значение, но с возможной привязкой к Подкарпатскому региону, где много сел с названием Поток.

Встречаются и попытки связать Потокер с профессией: например, «поток» могло означать некое устройство для перелива жидкости или часть мельничного механизма. Однако профессиональных фамилий с таким корнем в доступных ономастических источниках не зафиксировано, поэтому версия с «человеком у потока» выглядит убедительнее.

Фамилия почти не встречается в дореволюционных российских списках крестьян и мещан — это косвенно подтверждает её позднее появление в русскоязычной среде, скорее всего, через еврейское население черты оседлости. В современной России Потокер — единичная фамилия, носители которой могут быть потомками выходцев из Западной Украины, Белоруссии или Польши. Социальный контекст — ремесленники, мелкие торговцы или арендаторы, нередко получавшие фамилию по месту жительства при паспортизации в XIX веке.