Фамилия Пронькин образована от уменьшительного имени Пронька. Это не самостоятельное имя, а народная, бытовая форма целого ряда крестильных мужских имен, которые в повседневной речи звучали слишком торжественно или непривычно. Среди возможных первоисточников — Прокопий (в переводе с древнегреческого «преуспевающий»), Прокл («минувшая слава»), Протасий («передовой») и Прохор («запевала, руководитель хора»). Чаще всего ономасты склоняются к тому, что в основе лежит именно Прокопий: имя было широко распространено на Руси, а его краткие формы дали жизнь множеству фамилий.

Покровителем имени Прокопий считается мученик Прокопий Иерусалимский, пострадавший за веру при императоре Диоклетиане. Впрочем, для крестьянской среды решающим было не житие святого, а удобство произношения: имя Пронька звучало просто и привычно, поэтому его охотно использовали в быту, не задумываясь о церковном каноне.

Сама фамилия построена по самой распространенной на Руси модели: к основе Проньк- добавили суффикс принадлежности -ин, который указывает на родство. Буквально Пронькин означает «сын Проньки», «чей-то из семьи Проньки». Такая схема типична для фамилий, возникших в среде простого сословия, — у дворян чаще встречались фамилии на -ский или -ов, а вот -ин закрепился за именами, оканчивающимися на согласный или -а/-я.

Скорее всего, основатель рода Пронькиных был человеком из простого сословия — крестьянином или ремесленником. В документах фамилия встречается преимущественно в центральных и северных губерниях России. Например, в Книге памяти Калужской области упоминаются Агей Евдокимович Пронькин, родившийся в 1883 году в деревне Железница, и его сын Аким Агеевич Пронькин, появившийся на свет там же в 1905 году. Эта запись ценна не только как свидетельство бытования фамилии, но и как пример типичной семейной преемственности: имя отца Агей также относится к числу редких крестильных имен, что лишний раз подтверждает народное происхождение фамилии.

Интересно, что фамилия Пронькин не единственная, рожденная от этого прозвища. В родственных связях с ней состоят Пронкин, Пронсков, Прончатов и даже Пронин, хотя последняя может восходить и к другому имени. Это говорит о том, что имя Пронька было живым и продуктивным в словообразовании, а его носители расселялись по разным регионам, порождая местные варианты фамилии.