Основой фамилии Пронькинова послужило церковное имя Пронька. Имя Пронька – это производная форма одного из мужских крестильных имен: Прокл (греческое, «минувшая слава»), Прокопий (греческое «опережающий, преуспевающий»), Протасий (греческое, «передовой, первый») или Прохор (греческое, «запевала, руководитель хора»). Скорее всего, основатель рода Пронькиновых был выходцем из рабочей или крестьянской среды. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Пронька, со временем получил фамилию Пронькинов.