Фамилия Прудилин — один из тех случаев, когда географическая привязка оказывается важнее, чем кажется на первый взгляд. Её основа — слово «пруд», а суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Прудилин, то есть потомок человека по прозвищу или имени Прудила.

Ключевой вопрос — что такое «Прудила»? Скорее всего, это прозвище человека, жившего у пруда, владевшего прудом или занимавшегося его обустройством. В центральной России, особенно в чернозёмных и южных губерниях, пруды были важным элементом хозяйства: их копали для водопоя скота, разведения рыбы, полива огородов. Человек, который следил за таким прудом или выкопал его, мог получить прозвище Прудила. В говорах слово «прудить» означало не только «запруживать воду», но и «делать запруду, плотину». Таким образом, предок Прудилиных мог быть плотинным мастером или просто крестьянином, чей дом стоял на берегу заметного пруда.

Менее вероятная, но возможная версия — происхождение от нецерковного имени Прудило. На Руси были распространены имена от названий водоёмов (Озерко, Речка), и Пруд мог быть одним из них. Однако суффикс -ила (как в Городила, Косола) чаще образовывал прозвища по действию или качеству, а не уменьшительные имена.

Фамилия довольно редкая. Её ареал, судя по доступным данным, тяготеет к югу России — Воронежская, Тамбовская, Ростовская области. Это совпадает с зоной активного прудового хозяйства в XVIII–XIX веках. В отличие от массовых фамилий вроде Прудов или Прудников, форма Прудилин сохранила более архаичную, личную основу прозвища. В документах фамилия встречается с конца XIX века, в основном среди крестьян и мещан. Сословного барьера у неё не было: пруды копали и помещики, и их крепостные, но фамилия закрепилась именно за теми, кто эту работу выполнял или жил рядом.