Фамилия Пшенишный — редкий случай, когда основа слова прозрачна, а суффикс сбивает с толку. Корень здесь — «пшен-», тот же, что в слове «пшено» (просяная крупа). Но почему не Пшеничный? Ответ в диалектной или исторической фонетике: в южнорусских и украинских говорах «ч» перед «н» могло переходить в «ш» (сравните: «скучно» и «скушно», «яичница» и «яишница»). То есть Пшенишный — это тот же Пшеничный, но произнесённый по-народному, «с присвистом».

Модель образования типична для прозвищных фамилий: основа + суффикс -н- + окончание -ый. Суффикс -н- указывает на отношение к предмету: «пшеничный» значит «относящийся к пшенице, пшену». В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые часто означали «сын такого-то», модель на -ый в чистом виде (Пшенишный, Соленый, Кислый) закрепилась в основном на юге России и Украине, особенно в казачьей среде. Это не отчество, а прямое прозвище, данное человеку по его занятию, внешности или месту жительства.

Кем мог быть предок? Скорее всего, крестьянином, торговавшим пшеном или выращивавшим просо. Второй вариант — прозвище дали за внешность: «пшеничный» на Руси иногда говорили о человеке со светлыми, «соломенными» волосами, похожими на цвет пшеничной соломы. Третья версия, менее вероятная, но не исключённая: фамилия могла возникнуть от топонима — села или хутора с названием Пшеничное, Пшенишное (такие встречаются в Воронежской и Ростовской областях). Тогда носитель — выходец оттуда.

Географически фамилия Пшенишный привязана к югу России и востоку Украины. В переписях XIX века она встречается в Харьковской, Екатеринославской и Области Войска Донского. В центральных и северных губерниях преобладал «правильный» вариант Пшеничный, а южный, с «ш», остался локальной чертой.

В отличие от массовых фамилий вроде Иванов, Пшенишный не получил широкого распространения. Его носители — потомки тех, кто жил в определённом регионе и говорил на местном говоре. Сама фамилия сохранила для нас живую фонетику XIX века — звук, который литературный язык вытеснил, а народная речь удержала.