Фамилия Пукинский — хороший пример того, как географическая привязка перевешивает прозвищную основу. С первого взгляда её можно принять за «польскую» или «украинскую» из-за суффикса -ский, который в восточнославянских фамилиях часто указывает на происхождение от названия места. Но в данном случае корень «пук-» не даёт однозначной подсказки.

Самый вероятный путь образования: от названия населённого пункта — Пукино, Пукиничи или похожего. Такие топонимы встречаются в бывших польских и литовских землях, а также на западе современной России. Суффикс -ский в такой модели работал как маркер: «Пукинский» — тот, кто родом из Пукина или владел им. В дворянской среде это был способ указать на родовое поместье, но в крестьянской и мещанской — просто обозначить место рождения или прежнего жительства.

Корень «пук-» в славянских говорах многозначен. Он может восходить к диалектному «пук» — пучок, связка, клок (например, волос или сена), а также к глаголу «пукать» — издавать глухой звук, лопаться. В прозвищной версии Пука могли назвать человека с пышной шевелюрой или, наоборот, с негромким, но заметным голосом. Однако фамилия на -ский, образованная напрямую от прозвища, — случай редкий, чаще сначала возникало название села, а от него — фамилия.

В ономастическом словаре Б. Унбегауна фамилии на -ский с неочевидной основой он склонен относить к географическому типу, если нет явных фонетических или морфологических препятствий. Для Пукинского препятствий нет: основа прозрачна, а регионы возможного бытования (Псковщина, Смоленщина, Беларусь) как раз богаты на топонимы с корнем «пук-».

Есть и более прозаическая версия: фамилия могла возникнуть из искажённого написания. В старых документах, где писарь записывал фамилию на слух, «Путкинский» (от «путка» — пупок или от реки Путка) легко превращался в «Пукинский». Но это лишь гипотеза, не подтверждённая массовыми примерами.

Сословная принадлежность Пукинских не закреплена в истории. Среди носителей встречались и крестьяне, и мещане, и дворяне — последние, скорее всего, были мелкими помещиками, получившими фамилию по своему имению. Сегодня фамилия редкая, её концентрация заметна в центральных и западных областях России, а также в Беларуси, что косвенно подтверждает её западнорусское или белорусское происхождение.