Фамилия Пупырфаг — случай настолько редкий, что его сложно назвать фамилией в привычном русском понимании. Скорее всего, перед нами искусственное или заимствованное образование, которое не вписывается в традиционные славянские модели на -ов, -ин или -ский.

Если разбирать слово по составу, корень «пупыр» встречается в русских прозвищах: «пупырь» (шишка, волдырь, а также полный, толстый человек) и в фамилиях Пупырев, Пупырёв. Но вторая часть — «фаг» — для русского словообразования чужда. В биологии суффикс «-фаг» означает «пожиратель» (бактериофаг, сапрофаг). Получается комичная или гротескная конструкция вроде «пожиратель пупырей». Такое могли придумать в шутку, как литературный псевдоним или никнейм, который позже закрепился официально.

Другая версия — искажение при переписи. Если у предка была немецкая, еврейская или прибалтийская фамилия, звучавшая, например, как «Пупирфаг» или «Пуперфаг», писарь мог записать её на слух с русским корнем «пупыр». В любом случае, массового распространения фамилия не получила: в базах данных и телефонных справочниках России она почти не встречается.

По сословной принадлежности говорить не о чем — фамилия слишком редкая и, скорее всего, поздняя. Если вы носите фамилию Пупырфаг, велика вероятность, что она появилась в XX веке и не старше одного-двух поколений. Это не крестьянское прозвище, не дворянский герб, а, вероятно, курьёзный след чьей-то фантазии или канцелярской ошибки.