Фамилия Пусташинский — яркий пример восточнославянской фамилии на -ский, которая в большинстве случаев указывает на географическое происхождение её носителя. Такие фамилии были особенно распространены среди польской шляхты, украинской старшины и белорусской знати, а позже — и среди духовенства. Основа Пусташин- почти наверняка связана с названием населённого пункта — села, хутора или местечка Пусташи, Пусташино или Пусташин. Топонимы с корнем пуст- (пустошь, пустой, пустынь) встречаются по всей Восточной Европе: от Польши до Смоленщины. Человек, переехавший из такого места, получал прозвание по названию родины, а его потомки закрепили его как фамилию.

Суффикс -ин- в основе Пусташин- — притяжательный, указывающий на принадлежность: «Пусташин» могло означать «сын Пусташи» или «житель Пусташей». Однако в данном случае первичным, скорее всего, был топоним, а не личное прозвище. Само слово «пусташ» в старых говорах означало не только «пустое, незаселённое место», но и «заброшенный хутор» или «участок земли, вышедший из оборота». Соответственно, предок носителя фамилии мог быть либо основателем такого хутора, либо человеком, который поселился на пустоши после её запустения.

В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще носили крестьяне и посадские люди, фамилии на -ский долгое время оставались маркером более высокого социального статуса. В Речи Посполитой, откуда фамилия, вероятно, происходит, окончание -ский было типично для шляхты. Поэтому Пусташинские, скорее всего, были либо мелкопоместными дворянами, владевшими небольшим имением Пусташи, либо священниками, получившими фамилию по названию прихода или села, где служили.

Интересно, что фамилия Пусташинский редка и почти не встречается в современной России за пределами западных областей. Наибольшая концентрация носителей фиксируется в Беларуси и на Украине, что подтверждает её западнорусское происхождение. В польском языке существовала аналогичная фамилия Pustaszyński, которая со временем могла русифицироваться. Однокоренные фамилии — Пустовойтов, Пустынников, Пустошкин — имеют другую словообразовательную модель, но объединены тем же корнем, означающим отсутствие, пустоту или запустение.