Фамилия Путковская — женская форма, а мужская, Путковский, образована по типичной для восточнославянских земель модели с суффиксом -ск-. Такие фамилии чаще всего указывают на географическое происхождение: предок был родом из места с названием Путков, Путково или Путковичи. Подобные топонимы встречаются в Польше, Беларуси и на западе Украины — например, село Путков в бывшем Львовском воеводстве или деревня Путково в Тверской области России. Суффикс -ск- изначально был показателем принадлежности к местности (как в фамилиях Заболоцкий, Островский), а позже закрепился в фамилиях шляхты и духовенства, но со временем стал массовым.

Основа фамилии — корень путк-, который может восходить к нескольким источникам. Самое очевидное — древнерусское или польское слово «путь» (дорога), но с уменьшительным суффиксом -к-: «путок» или «путка» могло означать «маленькая дорога», «тропинка». Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным «путка» (почка на дереве) или даже с личным именем Путко — краткой формой от Путислав, Путимир или подобных славянских имён. В польской ономастике встречается фамилия Putkowski, и её носители могли быть выходцами из тех самых Путков.

Исторически Путковские — это не древний боярский или графский род, а, скорее всего, фамилия крестьян или мелкой шляхты, получившая распространение в XIX веке, когда массово закреплялись фамилии по названию деревни. Если предок жил в Путкове, его дети становились Путковскими — «те, кто из Путкова». В России фамилия редкая, чаще встречается в западных областях (Смоленская, Брянская, Псковская) и среди потомков переселенцев с территории бывшей Речи Посполитой.

Главная особенность Путковской — в её окончании. Обычно фамилии на -ский/-ская в России пишутся через «о» (Путковский), но в польском оригинале могло быть Putkowski, что при русификации дало «Путковский» без изменений. Путаница с ударением тоже возможна: в русском языке оно чаще падает на второй слог (ПуткОвская), но в польском — на предпоследний (ПуткОвска). Такая фамилия — хороший маркер смешанного польско-русского или западнорусского происхождения.