Фамилия Пузаненков — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, не связано с внешностью, а указывает на профессию или социальную роль. Вопреки первому впечатлению, корень «пузан» здесь не обязательно означает «человек с большим животом». В русских говорах, особенно южных и западных, «пузаном» называли не только толстяка, но и зажиточного, крепкого хозяина, у которого «пузо» — метафора достатка и сытости. Однако есть и другая, более конкретная версия: в некоторых регионах «пузанить» означало «медлить, канителить», а «пузан» — «нерасторопный, вялый человек». Но для фамилии Пузаненков правдоподобнее первое значение — прозвище по достатку.

Модель образования фамилии нестандартна. Суффикс -енков типичен для южнорусских и украинских территорий (ср. Бондаренко, Коваленко), где он означал «сын» или «потомок». В русском варианте Пузаненков — это «сын Пузана» или «внук Пузана», с двойным суффиксом: сначала -енк- (уменьшительно-родственный), затем -ов (притяжательный). Такая конструкция встречается реже, чем просто Пузанов или Пузанков, и указывает на более позднее оформление фамилии, вероятно, в XVII–XVIII веках, когда в документах активно фиксировали потомков по отчеству.

Географически фамилия тяготеет к западнорусским и украинским землям, особенно к бывшим Смоленской, Калужской, Брянской губерниям, а также к Воронежской области. Встречается она нечасто: по данным современных переписей, Пузаненковых в России — около полутора тысяч человек, что делает фамилию редкой. Основная масса носителей живёт в Центральном и Приволжском федеральных округах, но корни, скорее всего, ведут в чернозёмные области, где слово «пузан» в значении «зажиточный мужик» было в ходу.

Однокоренные фамилии — Пузанов, Пузанков, Пузань — различаются суффиксами и региональной привязкой. Пузаненков стоит особняком: он не просто «принадлежащий Пузану», а «происходящий из рода Пузаненко», то есть сохраняет украинский оттенок в основе. Это может говорить о том, что предок носителя фамилии был выходцем с Украины или из южнорусских земель, где такие патронимы были нормой. В сословном отношении Пузаненковы, скорее всего, были крестьянами или однодворцами — потомками служилых людей, осевших на южных рубежах. Точных данных о дворянстве этой фамилии нет, что подтверждает её простонародное происхождение.