Фамилия Пянтуков — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка связано с коми-пермяцким или коми-зырянским языком. В пользу этого говорит и ареал: фамилия встречается в Пермском крае, Республике Коми и на севере Кировской области, то есть на территории исторического расселения коми народов.

Корень «пянт» восходит к коми глаголу «пянтны» — «бояться, пугаться, робеть». Соответственно, Пянтук — это «пугливый человек», «трусишка». Такое прозвище могли дать не в обиду, а как бытовую характеристику: например, ребёнку, который шарахался от громких звуков, или взрослому, который осторожничал и избегал риска. Суффикс -ук (-юк) в коми языке образует имена и прозвища с оттенком носителя признака: Пянтук — буквально «тот, кто боится».

Русский суффикс -ов добавился при оформлении фамилии по стандартной модели, когда прозвище стало «сыном Пянтука» — Пянтуков. В отличие от многих русских фамилий, где основа — крестильное имя (Иван → Иванов) или профессия (Кузнецов), здесь мы видим прямую связь с характером предка. Это делает фамилию Пянтуков похожей на такие «психологические» фамилии, как Бояринов (от бояться) или Смехов, но с чёткой локальной привязкой к финно-угорскому субстрату.

Встречается вариант написания Пянтюков — с «ю» вместо «у». Это не ошибка, а результат диалектного произношения или влияния русской орфографии: в некоторых говорах коми звук «у» после мягких согласных воспринимался как «ю». Оба варианта считаются этимологически равноправными.

Дворянских корней у фамилии нет: Пянтуковы — это, скорее всего, черносошные крестьяне или, позднее, государственные крестьяне севера. Фамилия нечастотная, но устойчивая — её носители живут в тех же краях, где она возникла несколько веков назад.