Фамилия Ругин — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычного суффикса -ов/-ев, а значит, её основа — не отчество от крестильного имени. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Ругин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Руга. Но что значит «Руга»?

Самая прямая версия связана с древнерусским словом «руга», которое означало не брань, а плату натурой — хлебное или денежное жалованье, которое получали церковнослужители и причт. В этом смысле «Руга» — прозвище человека, который жил на церковном содержании, возможно, дьячка или пономаря. Такая версия правдоподобна, потому что фамилии на -ин от прозвищ, обозначающих род занятий или социальный статус, — обычное дело. Сравните: Попов, Дьяков, Пономарёв.

Менее вероятная, но возможная версия — отчество от нецерковного имени Руга, которое в древности давали по внешнему признаку (от глагола «ругать» в значении «бранить, кричать»). Однако в русской антропонимии прозвища с таким значением встречаются редко и обычно оформляются суффиксом -ов (Руганов). Поэтому первая гипотеза — через «ругу» — выглядит убедительнее.

В ономастических справочниках фамилия Ругин не относится к числу массовых. Она могла возникнуть в северных и центральных губерниях России, где институт церковной руги был распространён. Сословно носители, скорее всего, принадлежали к духовенству или крестьянам, состоявшим при церкви.

Интересно, что фамилия Ругин может быть и топонимической: есть несколько деревень с названием Ругино (например, в Костромской и Вологодской областях). В таком случае предок получил фамилию по месту жительства — «выходец из Ругина». Это добавляет ещё один слой к её истории, но не отменяет основного, «прозвищного» объяснения.