Фамилия Русто — редкий случай в русском ономастиконе. Она не вписывается в привычные модели на -ов, -ин или -ский, и это сразу подсказывает, что её происхождение, скорее всего, не крестьянское и не массовое, а либо позднее искусственное, либо иноязычное.

Самая очевидная версия — географическая. Русто — это топоним. В Италии есть коммуна Русто (Rusto) в провинции Салерно, а в Германии — населённый пункт Русто (Rustow) в земле Мекленбург-Передняя Померания. Носитель такой фамилии мог получить её по месту, откуда приехал его предок. В России подобные «чистые» топонимические фамилии без суффикса — редкость, они чаще встречаются у обрусевших немцев, итальянцев или прибалтийских народов. Например, немецкая фамилия Rustow (записанная на русский лад как Русто) хорошо известна: её носил знаменитый экономист Александр Рюстов (Alexander Rüstow). Если предки были выходцами из немецких колоний Поволжья или Причерноморья, фамилия могла закрепиться именно в таком написании.

Вторая версия — прозвищная, но более зыбкая. В русских говорах слово «рустый» означало «рыжий» или «русый» (с оттенком красноватого), а «русто» могло быть его краткой формой или диалектным вариантом. Однако подобные прозвища обычно давали суффиксальные окончания (Рустов, Рустин), а не обрубали до корня. Без суффикса фамилия выглядит как застывшая основа, что для восточнославянской традиции нетипично.

Третья, менее вероятная версия — искусственное происхождение. В XIX веке семинаристы иногда получали фамилии от латинских или греческих слов. Латинское rusticus — «деревенский, сельский, простой». Теоретически могли образовать Русто как усечённую форму, но это выглядит натяжкой: обычно семинарские фамилии оставляли более узнаваемые корни (Рустицкий, Сельский).

Главное, что отличает фамилию Русто, — её «незаконченный» для русского уха вид. Она не склоняется по падежам как типичная русская фамилия (Русто, к Русто, с Русто), что выдаёт её позднее закрепление или иноязычный след. Скорее всего, предки носителя этой фамилии — не крепостные крестьяне, а люди, получившие фамилию по названию места, откуда они переселились, или же это наследие немецких колонистов.