Фамилия Рыльцин — одна из тех, что заставляют задуматься: от какого слова она пошла? Сразу напрашивается связь с «рыло» — лицом, мордой, но это лишь вершина айсберга. На деле перед нами типичная «географическая» фамилия, образованная от названия населённого пункта, а не от прозвища. Основа здесь — топоним Рыльск, город в Курской области (известен с XII века). Житель Рыльска в старину назывался «рылец» или «рыльчанин», а его потомок легко мог получить фамилию Рыльцов или, с заменой суффикса, Рыльцин.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Рыльцин, то есть сын (или человек) Рыльца. Такая модель типична для фамилий, образованных от прозвищ и имён на -а/-я, но здесь она закрепилась за названием жителя. В русской ономастике есть и параллельная форма Рыльцев (с суффиксом -ев), что встречается не реже. Выбор между -ин и -ев мог зависеть от местного говора или случайной записи в документах.

Версия о происхождении от прозвища Рылец (связанного с «рыло») менее вероятна, но не исключена. В старину прозвища часто давались по внешности или характеру, и «рылец» могло означать человека с крупными чертами лица. Однако в случае с фамилией Рыльцин географическая привязка выглядит убедительнее: такие фамилии, как Рыльский, Рыльцев, Рыльцов, массово фиксируются в курских и орловских землях, где Рыльск — заметный центр.

Искать носителей фамилии стоит прежде всего в Центральной России и Черноземье. В XVIII–XIX веках крестьяне из-под Рыльска, переселяясь в другие губернии, уносили с собой фамилию, которая закреплялась за их потомками. Сегодня Рыльцин встречается нечасто, но сохраняет прямую связь с древним русским городом, что делает её понятной и прозрачной для этимолога.