Фамилия Рыпаева — женская форма фамилии Рыпаев, и чтобы понять её происхождение, нужно разобраться с мужским вариантом. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Рыпай. Глагол «рыпать» в русских говорах имел несколько значений: «дергать», «рвать», «вырывать с корнем», а также «беспокоить», «тревожить». Человек, получивший такое прозвище, мог быть суетливым, непоседливым или, наоборот, работать с грубой силой — например, корчевать пни или драть лыко. В словаре Владимира Даля зафиксировано и слово «рыпаться» — «порываться куда-то, суетиться». Так что Рыпай — это либо энергичный, порывистый человек, либо тот, кто занимался тяжелой физической работой, связанной с вырыванием.

Модель образования фамилии типична для русского Севера и Поволжья. Суффикс -ев (а не -ов) указывает, что основа прозвища оканчивалась на мягкий или шипящий согласный: Рыпай → Рыпаев. Такая модель особенно распространена в архангельских, вятских и пермских землях. Можно предположить, что географически фамилия Рыпаевы закрепилась именно в этих регионах, где говор сохранил архаичную лексику. Прямых параллелей с однокоренными фамилиями вроде Рыпалов или Рыпачёв почти нет — это делает Рыпаева редкой и локальной.

Вторая, менее вероятная версия, связывает фамилию с тюркским корнем. В татарском и башкирском языках есть слово «рып» — «горе», «беда», но для фамилии с русским суффиксом -ев это объяснение натянутое. Куда правдоподобнее, что Рыпай — исконно славянское прозвище, уходящее корнями в народную речь. Никаких документальных подтверждений знатности или принадлежности к дворянству у этой фамилии нет: скорее всего, предки носительницы были крестьянами или посадскими людьми, которых прозвали за характер или ремесло.