Фамилия Рыстафин образована от имени Рыстафи, состоящего из двух частей. Первая из них берет начало от древнетюркского имени Рыс со значением «счастливый». Вторая часть имени Рыстафи этимологически связано с именем Тави, которое в переводе с древнетюркского означает «первый ребенок в семье». Вероятно, родители назвали именем Рыстафи первого сына, которому они желали счастливой жизни. Таким образом, потомок человека, которого звали Рыстафи, со временем получил фамилию Рыстафин.