Фамилия Саинская — одна из тех, где географический суффикс -ск- обманчиво прост. Вопреки распространённому мнению, она не обязательно указывает на дворянское происхождение: по этой модели в XIX веке массово образовывали фамилии священники и семинаристы, а иногда и крестьяне, переселившиеся из другого места. Но главный вопрос — что стоит в основе.

Самый вероятный корень — топоним Саино. В России есть несколько деревень с таким названием: в Тверской, Псковской, Смоленской областях. Человек, переехавший из Саино в другую местность, мог получить прозвище Саинский, а затем и фамилию. Суффикс -ск- здесь работает как «выходец оттуда-то» — типичная модель для крестьянских и мещанских фамилий в XIX веке.

Вторая версия — искусственное происхождение в духовной среде. Семинаристам часто давали фамилии по названиям церковных праздников или по местным храмам. Если где-то существовала церковь, освящённая в честь святого Саина (редкое календарное имя, вариант от Савва или Савватий), то ученика могли записать как Саинский. Но эта гипотеза слабее: имя Саин в святцах почти не встречается, а значит, и храмов с таким посвящением единицы.

Иногда фамилию связывают с тюркским словом «саин» — «хороший, добрый». В южных регионах, где было сильное татарское или башкирское влияние, такое прозвище могло прижиться, но суффикс -ск- для русских фамилий тюркского происхождения нетипичен. Скорее всего, это случайное созвучие, а не реальный путь образования.

Окончание -ая указывает на женскую форму, но в русской традиции фамилия не склоняется по родам: Саинская — это и мужской, и женский вариант. Встречается фамилия редко, преимущественно в центральных и северо-западных областях России, что подтверждает связь с конкретными деревнями Саино. Носители могли быть крестьянами, мещанами или, реже, священниками — точных данных о сословной принадлежности предков без генеалогического поиска нет.