Фамилия Сакен в русском контексте — редкая и неоднозначная. Её происхождение почти наверняка не связано с тюркским именем Сакен (вариант имени Сагындык или Сакен — популярное казахское имя, означающее «осторожный», «осмотрительный»). В русской фамильной модели такое имя могло бы дать фамилию Сакенов или Сакенович, но не Сакен. Форма без суффикса — это либо искусственное заимствование, либо совсем другая история.

Скорее всего, перед нами немецкая фамилия. В немецком языке Saken — это форма множественного числа от Sake, что означает «дело», «тяжба», «процесс». В средние века так могли прозвать сутяжника, кляузника или, наоборот, человека, который постоянно участвовал в судебных разбирательствах как истец. Суффикс -en в немецких фамилиях часто указывает на принадлежность или множественность: буквально «из тех, кто судится» или «люди тяжбы». Географически фамилия Saken встречается в Германии, особенно в земле Северный Рейн-Вестфалия, а также среди российских немцев, которые могли привезти её в Поволжье ещё в XVIII веке.

Вторая, менее вероятная версия — топонимическая. В Латвии есть населённый пункт Сакены (Sakas pagasts), и фамилия могла возникнуть как указание на выходца оттуда. Однако в латышском языке форма чаще имела бы окончание -s или -is.

В русских документах фамилия Сакен могла появиться двумя путями. Первый — через обрусение немецкой фамилии: при переписи немец Saken записывался как Сакен, без изменений, так как окончание совпало с мужским родом. Второй — единичный случай, когда фамилию дали по имени Сакен, но без суффикса, что нетипично для русской традиции, но встречается у старообрядцев или в среде крещёных инородцев.

Таким образом, если ваши предки носили фамилию Сакен, стоит искать их корни либо среди поволжских немцев, либо в Прибалтике. Точное значение прозвища — «судебный человек» или «тяжебник», что указывает на занятие предка, связанное с правом и спорами.