Фамилия Сахалтуев — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает все прочие версии. В отличие от большинства русских фамилий, образованных от прозвищ или крестильных имён, эта фамилия, скорее всего, ведёт начало от названия конкретной местности — острова Сахалин.

Модель образования здесь прозрачна: основа «Сахалт-» (от «Сахалин») плюс суффикс -уев. Этот суффикс — один из вариантов патронимического -ев (чьи? — Сахалтуевы). Переход «Сахалин» в «Сахалтуй» в разговорной речи объясним: для русского уха название острова звучало как нечто инородное, и его быстро адаптировали, добавив типичное окончание -уй (сравните: «Иркут» — «Иркутск», но прозвище «Иркутуй»). Человек, получивший прозвище Сахалтуй, — это либо выходец с Сахалина, либо тот, кто долго там прожил или служил. В XIX — начале XX века, когда шло активное освоение Дальнего Востока и каторги на Сахалине, такое прозвище могли дать ссыльному, чиновнику или купцу, вернувшемуся с острова.

Версия, что в основе лежит тюркское или монгольское имя Сахалту (от «сахал» — борода), возможна, но маловероятна. Фамилия Сахалтуев почти не встречается в регионах традиционного проживания тюркских или бурятских народов. Напротив, её носители — в основном русские, и география фамилии (Сибирь, Забайкалье, Дальний Восток) прямо указывает на связь с Сахалином, а не с «бородатым» предком. Если бы корень был тюркским, мы бы ждали формы Сахалтов или Сахалтаев, а не с характерным русским суффиксом -уев.

Таким образом, Сахалтуев — пример «географической» фамилии, возникшей не по шаблону «сын такого-то», а по принципу «житель такой-то земли». Предок первого носителя фамилии, вероятно, был человеком, чья жизнь оказалась прочно связана с далёким островом на востоке империи.