Фамилия Сакишева — женская форма фамилии Сакишев, и её разбор стоит начать с суффикса. Здесь мы видим типичный русский патронимический суффикс -ев, который присоединяли к основам, оканчивающимся на мягкий согласный или шипящий. Сама основа — Сакиш — звучит нехарактерно для исконно русских имен, и это сразу указывает на тюркские корни.

Вероятнее всего, в основе лежит тюркское мужское имя или прозвище Сакыш. В тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) слово «сакыш» означает «мысль», «размышление», «ум». Встречается и вариант «сакиш» с тем же значением. Таким образом, Сакиш — это прозвище, которое могли дать человеку рассудительному, вдумчивому, задумчивому или, напротив, хитрому и расчётливому. Прямое значение — «мыслящий», «думающий».

Формант -ев, а не более редкий -ин, говорит о том, что фамилия оформлялась в русской среде по продуктивной модели, когда фамилия сына образовывалась от имени отца: «чей?» — Сакишев, то есть сын Сакиша. Географически фамилия Сакишевы наиболее распространена в Поволжье, особенно среди татар и башкир, а также встречается у казахов. Это неудивительно, так как именно в этих регионах тюркские имена активно входили в русскую фамильную систему через межэтнические контакты, крещение или переход в православие.

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с диалектным словом «сакиш» — так в некоторых говорах называли мелкую рыбёшку или остатки после нереста. Но эта гипотеза слабая: прозвище от названия рыбы чаще давали бы с уменьшительным суффиксом (Сакишок), и слово это узкорегиональное, в то время как тюркская основа объясняет и географию, и частотность фамилии. Итак, Сакишева — это «дочь или жена потомка Мыслящего», фамилия, которая несёт в себе отсылку к уму и характеру далёкого предка.