Фамилия Самалыков образована от имени Самалык. Оно, предположительно, берет начало от древнетюркской основы «самал» со значением «ветер». Возможно также, что имя Самалык этимологически связано с арабским прилагательным «самали», то есть «спокойный». Таким образом, потомок человека, которого звали Самалык, со временем получил фамилию Самалыков. Так, в документах упоминаются Абдулла Самалыков, родившийся в 1903 году в 6 ауле Кармакчинского района Южно-Казахстанской области, Абу Самалыков, родившийся в 1885 году в 19 ауле Кармакчинского района Южно-Казахстанской области.