Фамилия Самаринкин — редкий пример двойного суффикса в русской ономастике. Её основа — фамилия Самарин, а суффикс -кин указывает на более позднюю ветвь рода или на уточнение: «чей?» — Самаринкин, то есть потомок Самарина. Такая модель характерна для крестьянской среды XIX века, когда фамилии ещё не устоялись и могли обрастать дополнительными суффиксами при переписях или переходе в другое село.

Корень «Самар-» восходит к названию города Самара или к реке Самара (приток Волги). В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» отмечено, что фамилии на -ин от географических названий часто давали переселенцам: человек, пришедший из Самары, получал прозвище Самара, а его дети становились Самариными. Если же в той же деревне жили несколько семей Самариных, то для различения кого-то из них могли назвать Самаринкиным — буквально «внук Самарина» или «малый Самарин».

Возможна и другая версия: основа напрямую от прозвища Самаринка — так могли называть человека низкого роста или младшего в роду, который носил фамилию Самарин. Суффикс -к(а) в прозвищах часто имел уменьшительный или пренебрежительный оттенок, а затем закрепился в фамилии с двойным суффиксом. В любом случае, фамилия Самаринкин указывает на географическую связь с Самарой или Самарским краем.

По данным современных баз, фамилия встречается в основном в Поволжье и центральных областях России, что подтверждает её корни. Сословно носители могли быть как крестьянами, так и мещанами — двойные суффиксы редко встречаются у дворянства, где фамилии обычно имели более простую форму. В архивных документах XIX века Самаринкины фиксировались в Симбирской и Самарской губерниях, что дополнительно связывает фамилию с регионом.