Фамилия Самарина в своей основе почти наверняка содержит название города Самары. Это типичная «географическая» фамилия, которая закреплялась за человеком, переехавшим в другое место: его спрашивали, откуда он родом, и в ответ слышали «из Самары», после чего за ним и за его детьми закреплялось прозвище Самарин. Такой способ идентификации был очень распространен в XVI–XVII веках, когда город на Волге активно рос и превращался в крупный торговый центр. Именно в этот период, скорее всего, и возникла фамилия.

Существует и другая, менее вероятная версия, которая возводит фамилию к нарицательному слову «самара». Так в некоторых говорах называли длиннополую крестьянскую одежду, вроде армяка или кафтана. В этом случае прозвище Самара мог получить человек, носивший такую одежду или торговавший ею. Но эта гипотеза выглядит заметно слабее: топонимическое происхождение проще и логичнее, тем более что фамилия с таким корнем естественным образом ложится на известную модель именования по месту жительства.

Сама модель образования фамилии показательна и сама по себе. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Самарин буквально означает «сын Самарина» или «человек из семьи Самары». В русской ономастике фамилии с этим суффиксом исторически относились к простонародной среде — крестьянам, посадским людям, мелким служилым. В то время как знать и дворянство чаще получали фамилии на -ский/-цкий (например, Самарский), форма на -ин закрепилась за людьми более простого происхождения. Поэтому, если ваш предок носил фамилию Самарин, он, по всей вероятности, не был родовитым дворянином, а происходил из крестьян, ремесленников или купцов, которые перебрались с Волги в другие русские земли и сохранили в фамилии память о своей малой родине.