Фамилия Самии — редкий случай, когда в основе лежит не русское, а восточное имя. Её происхождение почти наверняка связано с арабским именем Сами (سامي), которое переводится как «возвышенный», «высокий», «благородный». В мусульманских культурах это имя широко распространено, и фамилия Самии образовалась по типичной для народов Кавказа и Средней Азии модели — прибавлением окончания -и, указывающего на принадлежность или происхождение. Таким образом, Самии — это буквально «из рода Сами» или «потомок Сами».

Словообразовательная форма фамилии — патронимическая, но не через русские суффиксы -ов/-ев, а через тюркский или персидский суффикс принадлежности -и/-лы/-лыг. В русском языке такие фамилии часто не склоняются, что и происходит с Самии: она остаётся неизменной по падежам. Это сразу отличает её от подавляющего большинства исконно русских фамилий и указывает на географию предков — скорее всего, Дагестан, Азербайджан, Татарстан или Средняя Азия.

Вторая, менее вероятная, но возможная версия — что фамилия восходит к финскому слову sami (саам). Однако в таком случае она писалась бы через «а» с ударением на первый слог (Са́мии) и была бы характерна для северных регионов России. Но учитывая, что подавляющее число носителей фамилии Самии в России и странах СНГ имеют кавказские или тюркские корни, арабская версия остаётся основной.

С точки зрения социальной истории, предки человека с фамилией Самии могли быть уважаемыми людьми в своей общине — имя Сами давали в надежде на высокое положение или благородный характер. Фамилия не несёт следов крестьянского или ремесленного прозвища, что отличает её от многих русских фамилий, образованных от профессий или черт внешности. Это «именная» фамилия, прямо указывающая на родоначальника.

Интересная деталь: в русском языке фамилия часто искажается при записи — можно встретить варианты Самий, Самиев, Самиян. Но подлинная форма — именно Самии — сохраняет исходную грамматику восточного патронима.