Фамилия Самкин образована от имени или прозвища Самка. На первый взгляд кажется, что в основе лежит название самки животного, но в русской ономастике этот вариант маловероятен. Прозвища, связанные с животными, обычно образовывались от названий самцов (Волк, Медведь, Петух), а женский род использовали редко, чаще в ироничном ключе — к слишком тихому или, наоборот, крикливому человеку. Но у Самкина есть более убедительная версия.

Скорее всего, основа — это уменьшительная форма крестильного имени Самуил. В народном произношении имя Самуил сокращали до Самойло, Самоха, а затем и до Самка. Такая модель словообразования типична: Ивашка → Васька → Петька, а Самка — логичное ласкательное сокращение. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Самкин, то есть сын или потомок Самки.

Вторая, менее распространённая версия — происхождение от прозвища Самак, которое давали самостоятельному, независимому человеку (от слова «сам»). Но в этом случае ожидалась бы форма Самакин, а не Самкин. Фонетически «сам» + суффикс -к- даёт именно Самка, что опять же возвращает к имени Самуил.

Интересная деталь: фамилия Самкин встречается в центральных и северных регионах России, где имя Самуил было в ходу у старообрядцев. В южных областях и на Украине преобладают формы Самойленко, Самойлов, а Самкин — более северный вариант. Это косвенно подтверждает связь с церковным именем, а не с животным миром. Если ваши предки носили эту фамилию, велика вероятность, что в роду был Самуил, которого в быту звали Самкой.