Фамилия Самкина — женская форма, а её мужской вариант — Самкин. В основе лежит нецерковное имя или прозвище Самка. В русской ономастике это слово имело не биологическое значение (как самка животного), а бытовое: «самка» в диалектах означала хозяйку, женщину, которая ведёт дом, или же просто «сама», то есть самостоятельная, независимая женщина. В некоторых говорах так называли наседку, что тоже отсылало к домашнему укладу.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Самкин — сын Самки, то есть потомок человека, которого в округе звали Самкой. Такая модель образования — одна из древнейших в русских фамилиях, характерная для северных и центральных регионов России. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще встречались на юге и востоке, -ин указывает на основу, оканчивающуюся на -а или -я.

Мужское имя Самка встречается в документах XVI–XVII веков. Например, в переписных книгах Новгородской земли упоминаются крестьяне с таким прозвищем. Это не было редкостью: в народе человека могли назвать по какой-то характерной черте — и «самка» здесь скорее указывала на самодостаточность или хозяйственность, а не на женственность.

Фамилия Самкина распространена неравномерно. Чаще всего её носители встречаются в Поволжье и на Урале, реже — в центральных областях. Встречаются и однокоренные фамилии: Самков, Самохин, Самылин — все они восходят к разным формам одного корня «сам-», но с разными суффиксами.

Если ваш предок носил фамилию Самкин, скорее всего, он был крестьянином или посадским человеком, а прозвище получил за самостоятельный характер или за то, что вёл хозяйство без чужой помощи. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано — это чисто народная, «низовая» ономастика.