Фамилия Самородный выделяется даже на фоне других прозвищных фамилий: её основа — прилагательное, а не существительное, что встречается реже. В большинстве случаев русские фамилии образовывались от прозвищ, имён или названий профессий через суффиксы принадлежности (-ов, -ин). Здесь же перед нами усечённая форма притяжательного прилагательного: Самородный буквально означает «сын (или человек) Самородного», то есть того, кого прозвали Самородный.

Корень «самород» в русском языке имеет два значения. Первое — прямое: самородок, кусок металла в чистом виде, найденный в земле. Второе — переносное: человек от природы одарённый, талантливый, «самородок». Прозвище Самородный могли дать либо удачливому золотоискателю или кузнецу, который находил или обрабатывал самородное золото, либо человеку с яркими способностями, который всему научился сам, без учителей. Второе значение более вероятно для фамилии: прозвища по личным качествам в крестьянской среде были распространены шире, чем по редкому профессиональному навыку.

Географически фамилия редкая. В дореволюционных списках она почти не встречается, что говорит о её позднем оформлении — скорее всего, в XIX веке, когда крестьяне массово получали фамилии после отмены крепостного права. Возможно, первоначально это было уличное прозвище, которое закрепилось за одной семьёй в конкретной местности. В современных справочниках Самородный изредка фиксируется в южных и центральных регионах России, а также на Украине, где суффикс -ный более типичен для фамилий украинского происхождения.

С точки зрения словообразования фамилия стоит особняком. У неё нет «родственников» с тем же корнем среди распространённых русских фамилий (как, например, Самородов). Суффикс -ный здесь не уменьшительный и не притяжательный, а адъективный — он превращает прозвище в готовое прилагательное, которое стало фамилией без дополнительных суффиксов. Это сближает её с такими фамилиями, как Белый, Кривой, Толстой, но в отличие от них Самородный не описывает внешность, а даёт оценку — уважительную или ироничную, в зависимости от контекста.