Фамилия Самыкова — женская форма от мужской Самыков, а та, в свою очередь, образована от личного имени или прозвища. Основа здесь — «Самык». Это краткая, разговорная форма от крестильного имени Самуил (древнееврейское «услышанный Богом») или от имени Савва (арамейское «старец, дед»). В русской традиции такие усечения — Самык, Самыка — были нормой: Самуила в быту звали Самойло, а от него уже пошли уменьшительные Самка, Самык. Суффикс -ов (в мужском варианте) указывает на принадлежность: «сын Самыка». То есть Самыковы — потомки человека, которого в обиходе звали Самык.

Если же предположить тюркское происхождение, то «самык» могло быть прозвищем от слова со значением «упрямый», «назойливый» или «болтун». У башкир, татар и казахов встречаются имена и прозвища с корнем «сам-» (сам — «слово», «весть»). Однако для фамилии с русским суффиксом -ов/-ова тюркская версия менее вероятна: такие фамилии обычно возникали при активных контактах с русским населением, но тогда основа чаще оставалась без изменений, а суффикс добавлялся по русской модели. В случае с Самыковым мы видим именно русскую модель от краткого имени — это самый частый путь.

Географически фамилия Самыков встречается в Поволжье и на Урале, особенно у татар и башкир, но также у русских. Это объяснимо: в регионе веками жили рядом разные народы, и имя Самуил в русской огласовке «Самойло» давало множество производных, которые легко переходили в фамилии. В татарской среде могла произойти обратная ситуация: местное имя или прозвище Самык получило русский суффикс при оформлении документов.

Сословная принадлежность у Самыковых не закреплена: фамилия встречалась и у крестьян, и у мещан, и у духовенства. В метрических книгах XIX века можно найти Самыковых среди государственных крестьян Казанской и Вятской губерний. Никакой особой знатности или редкого ремесла за фамилией не числится — это рядовая русская (или обрусевшая) фамилия, образованная по самому распространённому принципу: от имени предка.