Фамилия Самыкина образована от мужского личного имени Самыка — просторечной, обиходной формы крестильного имени Самуил. В переводе с древнееврейского оно означает «услышанный богом» (Шемуэль). Такое сокращение имени — не редкость в русской традиции: усечённая основа с суффиксом -ык-/-ик- придавала имени ласковый, домашний оттенок, характерный для бытового общения в среде простых людей.

Фамилия относится к самой распространённой модели русских фамилий — на -ин. Суффикс -ин присоединялся к основам, оканчивающимся на -а/-я, и указывал на принадлежность: Самыка → «чей сын?» — Самыкин. Женская форма Самыкина исторически означала «дочь или жена Самыкина», но в современном употреблении это та же фамилия, переданная по женской линии.

Скорее всего, основатель рода Самыкиных был человеком из простого сословия — крестьянином, ремесленником или посадским. В дворянской среде подобные уменьшительные формы почти не использовались при образовании фамилий, там предпочитали полные канонические имена. А вот в народной среде имя Самыка встречалось в документах XVI–XVII веков, когда фамилии только начинали закрепляться за крестьянскими и посадскими семьями.

Важно не путать эту фамилию с однокоренными, но иными по происхождению: Самарин, Самохин, Самылин. Часть из них восходит к другим формам имени Самуил, часть — к прозвищам от слова «сам» (в значении «сам себе хозяин»). Для Самыкина же связь с именем Самуил наиболее прямая и подтверждается самой основой: без уменьшительного суффикса -ык- здесь не обошлось.

Таким образом, потомок человека по имени Самыка со временем получил фамилию Самыкина, и в ней сохранилась память о том, как в старину называли ребёнка в семье — коротко, тепло и по-домашнему.