Фамилия Санатовский — наглядный пример того, что в основе многих русских фамилий лежит не имя, а географическое название. Её образует суффикс -ский, который в подавляющем большинстве случаев указывает на происхождение от топонима: названия населённого пункта, местности или владения. Носитель такой фамилии — это, как правило, выходец из места, именовавшегося Санатово или Санатовка, либо потомок человека, владевшего таким имением.

Прозрачная основа «Санат-» заставляет искать корни в славянском слове «санаторий»? Нет, это позднее заимствование. Гораздо вероятнее, что название села или деревни связано с диалектным или устаревшим словом. В украинском и южнорусских говорах «сана́та» — это суета, хлопоты или же капризный, привередливый человек. Если поселение назвали в честь прозвища первопоселенца (Саната), то фамилия Санатовский могла означать «сын Санаты» или «выходец от Санаты». Однако более надёжная версия — топонимическая: на картах Российской империи, особенно на территории современной Украины и Беларуси, встречались хутора и сёла с названием Санатовка, Санатово. Переселенцы, покинув родные места, получали фамилию по названию покинутого гнезда.

Стоит отметить, что фамилия эта — довольно редкая, что косвенно подтверждает её узколокальное происхождение. В отличие от массовых «Ивановых» или «Кузнецовых», Санатовский не мог возникнуть в каждом уезде. Её носители — это, скорее всего, потомки шляхты или однодворцев, живших компактно в одном регионе. В дворянских родословных книгах фамилия не зафиксирована как титулованная, что говорит о её происхождении из мелкопоместного или казачьего сословия.

Интересна и словообразовательная параллель. Фамилия построена по той же модели, что и, скажем, Санатов, Санаткин, но с прибавлением суффикса принадлежности к месту. Если «Санатов» — это «чей?» (сын Саната), то «Санатовский» — это «откуда?» (из Санатово). Это различие часто ускользает, но для этимолога оно принципиально: вторая модель характерна для фамилий, которые оформлялись в более позднее время, в XVII–XIX веках, когда люди активно переселялись и им требовалось указать на покинутую родину.