Основой фамилии Санченко послужило мирское имя Саня. Фамилия Санченко восходит к каноническому мужскому имени Александр, которое в переводе с греческого означает «мужественный; защитник людей». Просторечная форма этого имени – Саня – и легла в основу этой фамилии. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Саня, со временем получил фамилию Санченко.