Фамилия Сапарханов образована от тюркского мужского имени Сапархан. Оно, в свою очередь, является составным и восходит к двум основам: имени Сапар и компоненту «хан». Имя Сапар представляет собой казахский, киргизский и туркменский вариант арабского имени Сафар, что в переводе на русский язык означает «родившийся в месяце сафар».