Фамилия Сайчишина — женская форма, мужской вариант — Сайчишин. Основной вопрос в этой фамилии — её корень. Слово «сайчиш» не встречается в современных словарях русского языка, что указывает на нерусское или диалектное происхождение основы. Вероятнее всего, фамилия образована от прозвища или имени, связанного с тюркскими языками. В тюркских наречиях (татарском, башкирском, казахском) основа «сай» имеет несколько значений: «мелкий», «выбирать», «почтенный», а также может быть частью сложных имён (например, Сайфулла). Суффикс «-чи» в тюркских языках указывает на профессию или род занятий (ср. «сайчи» — тот, кто занимается отбором, сортировщик, или человек, живущий у «сая» — оврага, лога). Таким образом, «Сайчи» могло быть прозвищем человека, работавшего сортировщиком зерна или жившего в овражистой местности.

Русский суффикс «-ин» (в форме Сайчишин) стандартно указывает на принадлежность: «чей?» — сын Сайчи. Фамилия закрепилась в среде, где русское население контактировало с тюркским — вероятно, в Поволжье, на Урале или в Сибири. Встречаемость фамилии крайне низкая, что говорит о её локальном характере: носители, скорее всего, потомки одного рода, вышедшего из смешанной этнической среды.

Есть и менее вероятная версия, связывающая фамилию с украинским или белорусским диалектным словом «сайка» (род булочки) через прозвище Сайка, но это потребовало бы суффикса «-ишин», а не «-ичин». Форма Сайчишин однозначно указывает на основу «Сайч(а)» — усечённый вариант от «Сайчи». Географически фамилия тяготеет к южноуральскому региону, где фиксируются единичные записи в метрических книгах XIX века. По сословной принадлежности предки, скорее всего, были государственными крестьянами или казаками, занимавшимися хлебопашеством и скотоводством — типичный фон для тюрко-славянского пограничья.