Фамилия Сайтаков образована по стандартной для русского языка модели с суффиксом -ов, который указывает на принадлежность: «чей?» — Сайтаков, то есть сын или потомок человека по имени или прозвищу Сайтак. Основа фамилии — тюркское или монгольское личное имя Сайтак, которое встречается у многих народов, от казахов и татар до алтайцев и хакасов. В основе имени лежит древний корень «сай» со значением «выбирать, отбирать, почитать», а компонент «так» может быть усилительной частицей или суффиксом, придающим имени значение «избранный, почётный, достойный».

География фамилии в России в основном привязана к регионам, где исторически сильны тюркские и монгольские языки: это Татарстан, Башкортостан, Оренбургская область, а также Алтай и Хакасия. Встречается она и у сибирских татар. Интересно, что в некоторых тюркских языках слово «сайтак» могло означать не только личное имя, но и прозвище — например, «упрямый» или «своенравный», что тоже могло стать основой для фамилии, но эта версия менее вероятна, так как имя Сайтак хорошо документировано как антропоним.

Сословно предки Сайтаковых в большинстве случаев были крестьянами или казаками, особенно в южноуральских и сибирских казачьих войсках, где фамилии тюркского происхождения не редкость. Дворянских родов с такой фамилией в исторических списках не зафиксировано, что типично для фамилий, образованных от народных имён, а не от церковных календарных.

В написании фамилии возможны варианты — Сайтаков, Сайтаков, но в русской орфографии закрепилась форма с буквой «й», так как она точнее передаёт звучание исходного имени. Сравните с родственными фамилиями: Сайтанов (с другим суффиксом), Саитов (от имени Саит), Сайфутдинов (арабско-тюркское имя). Сайтаков стоит в этом ряду особняком, потому что его основа — не арабское, а исконно тюркское или монгольское имя, что делает фамилию маркером древних степных корней.

Коротко: Сайтаков — фамилия тюркского происхождения, образованная от имени Сайтак («избранный»), распространённая у татар, башкир и народов Сибири.