Фамилия Сантаков — редкий случай, когда основа почти наверняка не славянская, а тюркская, но оформлена по русской модели. Если коротко: перед нами фамилия, образованная от личного имени Сантак с помощью патронимического суффикса -ов. Вопрос в том, что значит само имя Сантак.

Здесь возможны две версии, и обе ведут в тюркский мир. Первая: Сантак — вариант имени Сандык или Сандак, которое восходит к тюркскому слову со значением «сундук», «ларь». В переносном смысле так могли прозвать крепкого, основательного человека или того, кто хранил что-то важное. Вторая версия связывает имя Сантак с тюркским сан — «число», «счёт», «достоинство», «честь». Тогда Сантак могло означать «почётный», «уважаемый» или «счётчик». Оба варианта правдоподобны, но первый, «сундук», встречается в тюркской антропонимии чаще и мог стать прозвищем по внешности или профессии.

Обратите внимание на суффикс -ак. В тюркских языках это уменьшительно-ласкательный или усилительный аффикс. Сантак — это не полное имя, а скорее прозвищная форма, что-то вроде «сундучок» или «счётный». Такие прозвища давали в быту, а уже потом, при крещении или переходе в православие, они закреплялись как фамилии.

География фамилии подсказывает, что искать её корни стоит в регионах, где русские долго и плотно контактировали с тюркскими народами: Поволжье, Приуралье, Сибирь. Среди татар, башкир, чувашей или казахов имя Сантак (Сандык) встречается, а русские Сантаковы, скорее всего, потомки крещёных тюрков или людей, получивших прозвище от тюркского соседа.

Словообразовательная модель проста: тюркская основа Сантак + русский суффикс -ов (чей? — Сантаков). Фамилия не дворянская, не священническая — это типичная крестьянская или казачья фамилия, возникшая в среде простого народа. В дореволюционных списках она почти не встречается, что говорит о её позднем оформлении и локальном бытовании.